软件简介
PopGene(Population Genetic Analysis)是一款专业的群体遗传学分析与遗传多样性研究软件,由加拿大阿尔伯塔大学的 Francis C. Yeh、Rong-cai Yang 等研究人员联合开发,主要用于群体遗传结构分析、遗传多样性评估、基因频率计算及群体间遗传关系研究。软件具有免费使用、操作简便、统计分析功能丰富等特点,广泛应用于遗传学、分子生物学、植物科学、动物遗传育种、生态学及高校科研等领域。
PopGene 具备强大的遗传多样性分析与群体遗传参数计算能力,支持显性和共显性分子标记数据分析,可用于 RAPD、ISSR、SSR 等分子标记研究。软件能够计算等位基因频率、有效等位基因数、观察杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Nei 基因多样性指数、Shannon 信息指数以及多态位点百分率(PPL)等指标,帮助科研人员评估不同群体内部及群体之间的遗传变异水平。
此外,PopGene 提供完善的群体遗传结构与遗传分化分析功能,支持 Hardy-Weinberg 平衡检验、遗传分化系数(FST、GST)、基因流(Nm)估算、遗传一致度及遗传距离计算等。用户可以通过分析不同群体之间的遗传差异,研究种群遗传结构、遗传分化程度及潜在的基因交流情况,为物种保护、种质资源评价和遗传育种研究提供数据支持。







